Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD1Q15116 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD1Q15116 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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