Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCLAFQ15004 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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