Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RFTN1Q14699 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms