Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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