Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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ATP1A4Q13733 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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ATP1A4Q13733 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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ATP1A4Q13733 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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ATP1A4Q13733 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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