Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEUROD1Q13562 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEUROD1Q13562 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
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