Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5R2Q13319 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms