Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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