Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTP4A2Q12974 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTP4A2Q12974 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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