Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLFN5Q08AF3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN5Q08AF3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms