Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL16A1Q07092 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL16A1Q07092 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms