Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms