Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAP2Q03519 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAP2Q03519 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms