Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms