Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MC1RQ01726 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MC1RQ01726 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms