Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms