Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms