Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHC1P78364 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHC1P78364 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHC1P78364 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHC1P78364 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms