Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VBP1P61758 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VBP1P61758 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VBP1P61758 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VBP1P61758 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VBP1P61758 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VBP1P61758 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms