Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2FP61218 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms