Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTBP2P56545 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms