Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC4P56524 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms