Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RECQLP46063 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RECQLP46063 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RECQLP46063 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RECQLP46063 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RECQLP46063 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RECQLP46063 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RECQLP46063 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RECQLP46063 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RECQLP46063 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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