Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MLH1P40692 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MLH1P40692 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MLH1P40692 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MLH1P40692 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MLH1P40692 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MLH1P40692 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MLH1P40692 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MLH1P40692 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MLH1P40692 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MLH1P40692 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MLH1P40692 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MLH1P40692 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
MLH1P40692 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MLH1P40692 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms