Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACVR1BP36896 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACVR1BP36896 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms