Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1E1P36543 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms