Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRS3P32247 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRS3P32247 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms