Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms