Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms