Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4AP27815 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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