Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD247P20963 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD247P20963 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD247P20963 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD247P20963 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CD247P20963 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms