Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RHCEP18577 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RHCEP18577 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RHCEP18577 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RHCEP18577 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms