Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB3P14651 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB3P14651 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms