Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms