Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms