Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPSAP08865 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPSAP08865 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPSAP08865 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPSAP08865 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPSAP08865 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPSAP08865 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPSAP08865 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPSAP08865 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPSAP08865 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPSAP08865 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPSAP08865 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms