Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTMAP06454 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTMAP06454 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTMAP06454 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTMAP06454 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTMAP06454 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTMAP06454 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTMAP06454 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTMAP06454 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTMAP06454 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTMAP06454 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTMAP06454 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTMAP06454 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTMAP06454 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms