Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24BO95487 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms