Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC22O60826 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC22O60826 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC22O60826 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC22O60826 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC22O60826 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC22O60826 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC22O60826 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC22O60826 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC22O60826 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC22O60826 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms