Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SSX5O60225 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSX5O60225 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX5O60225 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX5O60225 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX5O60225 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX5O60225 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX5O60225 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX5O60225 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSX5O60225 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms