Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM2O43147 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM2O43147 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms