Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms