Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP4-16G5E9R7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms