Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms