Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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