Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00312Q9Y6C7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms