Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPS5Q9UPZ3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPS5Q9UPZ3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms