Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX7Q9UNH6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX7Q9UNH6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms