Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CIZ1Q9ULV3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIZ1Q9ULV3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIZ1Q9ULV3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIZ1Q9ULV3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIZ1Q9ULV3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIZ1Q9ULV3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIZ1Q9ULV3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms