Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms